整个学院规划得完整、合理并且学生们可能需要的东西都应有尽有！根据方程临走时对余一恩提出的建议，这整个修灵学院被分成了三个部分！分别是主体修灵学院、暗卫学院和文华学院。
修灵学院顾名思义，就是教学生们学习修灵的学院，而暗卫学院则是方程与海城内设置的考取暗卫的部门共同商议出来的结果，他们将考取暗卫的整个流程搬到了这个暗卫学院中去！有一些相对来说生活阶级比较一般的孩子或者是成年人想要考取暗卫，那么就可以来报名这个暗卫学院！暗卫学院是专门教大家如何能够成功考取暗卫的学院，所以它被方程分设出去，并且由本身就是甲级暗卫的钱玉阳来作为暗卫学院的院长！再有一个就是方程让李兆文担任院长的文华学院！文华学院其实就相当于是外面设立的书屋，方程也是将海城几个比较大、比较有名气的书屋整合到了一起，将其中的教书先生也拉到了这个文华学院里面，让他们在这样一个更有氛围、更有条件的环境中来进行教学，这也是这些教书先生所愿意见到的！李兆文最不喜欢读书了，他也真的是搞不明白为什么方程会让自己来当这个文化学院的院长，不过讨论到最后，他终于明白了！原来这个文华学院并不仅仅是教孩子们读书的，它居然还有科学课和简单基础的数学课堂！这可是万神界里从来没有过的课程，当然，也是李兆文十分感兴趣的课堂！李兆文不仅仅是院长，还是这个学院目前为止唯一一个老师！方程还给李兆文下达了一个命令，让他在整个万神界招募对这些科学、或者一些先进理念感兴趣的人来做科学课的老师。
李兆文招募的第一个人就是他的内人——小麒！他把小麒推到了数学课上，让她成为了一名基础数学的老师！好在小麒在那个世界也上过了好几次小学、中学和大学，对于教授这个基础数学课堂还是没有什么问题的！方程这是在力求将另一个世界的文化、社会模式传到万神界这里来，让他们的生活和知识水平有一个质的飞跃！因为后来的万神界主十分严格的控制万神界与外界同行的通道，所以万射界的发展几乎已经是停滞不前的了！他们还一直维持在方程他们所在的那个世界几百年前的模样。
这中间再没有外界的人走进来，带着他们向前发展，直到方程他们的到来！只是几百年的空挡时间太久了，方程不可能在一朝一夕之间改变这里，他只能尽力的去做一些自己力所能及的事情了！除了修灵学院，他还想做一些其他的，比如医院产业、医药业、教育业、餐饮娱乐，这些他都想要在万神界种下种子，只不过这都要慢慢来！在万神界所有事情解决完，他们离开的那一天，他希望自己种下的种子可以生出嫩芽，至于如何开枝散叶、开花结果，那就要看后来的人们是否能够将他种下的种子保护好了。
目前，方程最需要做的就是将整个修灵学院做好！然后不断地扩大他们所要教学的东西，尤其是一些实用的学科类或者是可以增加收益的行业，百姓们在受益于修灵学院之后才会更加的支持它，这才是一样东西或者是一个事业能够长久的坚持下去的理由和原因！方程的想法很大，他想改变这个收留了自己的万神界；方程的想法其实也很简单，他只是希望这里的人们，能过过上更好一些的生活，至少那样证明了自己没有白来这一趟！