这时发生了一件让大家意想不到的事件，乔丹的复出蒙上了阴影。7月17日，乔丹在训练赛中被阿泰斯特撞断了肋骨，难道乔丹真的老了，他的身子骨如此脆弱所有人都认为这件事会直接影响乔丹的复出，一是乔丹的伤会不会按时痊愈，如果不能，就算乔丹可以赛季中旬加盟奇才，可是他能很快适应吗第二，乔丹的减肥计划不得不被搁浅，这样已经发福的乔丹还能达到他的理想体重吗
这个时候，曾经在乔丹第一次复出时笑称为美国增加了一个新就业额的克林顿站了出来，他没有明确的给乔丹打气，他只是赞扬乔丹以往的辉煌，借此来表明对乔丹付出的期待“我们祝愿乔丹万事如意。我们崇拜他，非常喜爱他，我们感谢他多年来给我们带来的惊喜和业绩。在我的一生中，我还从没有看到有其他的运动员能将头脑、身体和精神诸素质结合得像他那样精美。我认为美国的体育迷用一到两天的时间发出喔、啊的感叹是很正常的。希望人们能再次屏住呼吸，再次高兴起来。要知道乔丹的退役对热爱篮球、热爱运动的全世界球迷来说是一个悲伤的消息。”第一夫人希拉里是公牛队的铁杆球迷“与其他的美国先驱，如莱特兄弟一样，乔丹确实证明了人类可以飞翔。”
不过此时的乔丹已经不再是那个飞翔在天的家伙了，他沉稳的扎根于地面，小心翼翼的保护着双腿，以防它们像肋骨那样折断。被外界逼得太狠了，乔丹只好采用拖延战术“再给我一个半月的时间吧，9月中旬我将给大家一个满意的答复。”
于是乔丹明显没有放弃复出，在肋骨伤好后，乔丹又开始了训练“我希望打球，我希望能达到我应有的水平，我想这也是有挑战性的。我也许再也不能从罚球线上飞起扣篮了，但其实在96年我赢得总冠军的时候我就不能从罚球线上飞起来了。我想每个人都想为我指出一条正确的道路，但说实话我得对自己负责，我现在正在对自己的体能进行正确的评估，努力寻找一些打球时的感觉和状态。”
随着乔丹所预定宣布复出日期的临近，一切都显得乱了套，总裁斯坦恩也忙得不可开交。有人甚至说，斯坦恩和联盟副总裁格兰尼克每10分钟就给乔丹打一次电话，告诉多么需要他。这当然是一个笑话，斯坦恩就算真想每10分钟打个电话，他也没有那么多的时间来只关注一名球员，所有球员和员工加在一起足足过千，大家大业都靠斯坦恩一个人支持，乔丹毕竟不能取代整个。
不过从此可以看出一个讯号，就是乔丹真的对很重要，他甚至成了电影业中的名词票房灵药。确实，乔丹实在是运动业的一个绝对价码，他退役前对美国每年产值高达2500亿美元的体育产业施加着巨大影响。据财富杂志评估，受乔丹影响的相关产业具有百亿美元。
体育市场探秘一书的作者卡特尔指出乔丹使体育产品畅销，他在这方面的影响领先了其他明星100英里。乔丹的退役对体育服装的龙头老大耐克公司影响最大，耐克公司的股票一天跌了236美元，道琼斯指数下降了125点，这些大概和乔丹退役不无关联。要知道，耐克公司多年中单从销售乔丹服装鞋帽上便盈利了26亿美元。
9月11日，到了乔丹该宣布复出与否的时间了，乔丹又选择了逃避，或者说他再次钓人胃口我需要考虑，但是很快，很快我就将正式复出，我这么做是出于对篮球的热爱。很快，9月26日，乔丹正式宣布复出，与奇才签下两年合约，年薪100万。乔丹在复出声明中称，他将把第一年的工资收入全部捐献给因911恐怖袭击而遭受苦难的人们。
10月2日，奇才的季前训练营在乔丹的家乡威尔明顿市开营，乔丹参加了他复出后的首次训练。当天，有包括湖人在内的多支球队的训练营开营，但由于乔丹巨大的个人魅力，以往门前冷落鞍马稀的奇才训练营此次却成了万众瞩目的焦点。在奇才队进行训练的斯特拉克体育馆外，就停了9辆卫星电视转播车，前来采访的记者多达100多人。上午9点多钟，奇才准时来到体育馆，乔丹也在其间，他的神情轻松而平静。